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序列順序比對(duì)工具（按照生化性質(zhì)標(biāo)記顏色） - Sequence Manipulation Suite

序列順序比對(duì)工具（按照生化性質(zhì)標(biāo)記顏色）可以分析FASTA格式或者GDE格式的序列，并根據(jù)生化性質(zhì)標(biāo)記顏色。此工具會(huì)檢測(cè)每一個(gè)氨基酸位，如果不同序列的相同氨基酸位氨基酸相同則標(biāo)記為相應(yīng)的彩色。您可以配置堿基位相同比率參數(shù)（氨基酸相同個(gè)數(shù)/氨基酸總數(shù)），大于此參數(shù)的話，標(biāo)記顏色才會(huì)被應(yīng)用。使用此工具可以用來(lái)標(biāo)記生化性質(zhì)保守的蛋白片段

粘貼FASTA格式或者GDE格式的序列，輸入長(zhǎng)度限定在200000以下。

>CremaneiFEM-2
-------------------MSDSLNHPSSSTVHADDGFEPPTSPEDNNKK
PSLEQIKQEREALFTDLFADRRRSARSVIEEAFQNELMSAEPVQPNVPN-
-PHSIPIRFRHQPVAGPAHDVFGDAVHSIFQKIMSRGVNADYSHWMSYWI
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AEYCDILSEKWTGIHVSADQLKGQRNKQEDRFVAYPNGQYMNRGQ-SDIS
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YNDLAHYICHEAIAHGSTDNVTVVIGFLRPPQDLWRMMKIDEESDEEEDE
VDDE--

每行顯示個(gè)氨基酸殘基..
堿基位相同比率達(dá)到: %顏色才被用于標(biāo)記
顏色標(biāo)記方法 .

輸入每條序列比對(duì)的開(kāi)始位置，形式如0, 200, 0, -1。如果位置未被指定，則默認(rèn)為序列從頭開(kāi)始（0位）。

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